Môn Phẫu thuật thực hành được bắt đầu giảng dạy tại Trường Đại học Y khoa Huế từ năm 1975. Trong 7 năm đầu tiên, bộ môn nằm trong liên bộ môn Ngoại - Giải phẫu - Phẫu thuật thực hành. Từ năm 1983, PTTH và Giải phẫu được tách thành một bộ môn độc lập do Ths. Nguyễn Kim Hải giữ chức Phó chủ nhiệm cho đến năm 1991, PTTH được chuyển sang hệ lâm sàng ngoại trong Bộ môn Ngoại. Đầu năm 1999, PTTH đã được Đại học Huế và Trường Đại Học Y khoa tách thành một bộ môn độc lập, bổ nhiệm Ths. Nguyễn Kim Hải làm Trưởng bộ môn, biên chế ban đầu là 3 cán bộ và đến nay đã được bổ sung thêm 2 cán bộ giảng dạy.